BIOINFORMATICS & COMPUTATIONAL BIOLOGY

BIOINFORMATICS & COMPUTATIONAL BIOLOGY

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iten
Codice
90527
ANNO ACCADEMICO
2017/2018
CFU
9 cfu al 1° anno di 9014 INFORMATICA (LM-18) GENOVA
SETTORE SCIENTIFICO DISCIPLINARE
INF/01
LINGUA
Inglese
SEDE
GENOVA (INFORMATICA)
periodo
2° Semestre

PRESENTAZIONE

Il corso di Bioinformatics & Computational Biology ha l’obiettivo di fornire gli strumenti per la soluzione di problemi di analisi di dati biomedicali in alta dimensione. 

Il corso prevede attività di didattica frontale e laboratori guidati per consolidare gli argomenti visti in classe.

Il corso ha un forte connotato applicativo. Oltre ai laboratori,  lo studente svilupperà un progetto nel quale sarà richiesto di risolvere un problema complesso in autonomia.

OBIETTIVI E CONTENUTI

OBIETTIVI FORMATIVI

Students will learn basic elements in pipeline of high-throughput data analysis: crash course on molecular biology; overview on sequencing technologies; alignment and normalization algorithms; QC criteria unsupervised and supervised learning methods for subtyping and data exploration as well as variable selection and functional characterisation; network reconstruction algorithms. Students will be involved in project activities.

Modalità didattiche

Lezioni in aula (44 ore), in laboratorio (12 ore), progetto (50 ore) e studio a casa.
Gli studenti dovranno frequentare le lezioni ed i laboratori per un totale di 6 ore a settimana.

PROGRAMMA/CONTENUTO

I temi affrontati saranno:

  • introduzione alla data science in ambito  biomedicale e ai dati molecolari
  • normalizzazione e pre-processing di dati molecolari in alta dimensione
  • selection bias
  • riduzione di dimensionalità
  • selezione di variabili: metodi filtrowrapper e embedded
  • enrichment 
  • inferenza di network molecolari
  • dictionary learning

DOCENTI E COMMISSIONI

Ricevimento: Ricevimento su appuntamento (e-mail)

Commissione d'esame

ANNALISA BARLA (Presidente)

VERONICA TOZZO

ALESSANDRO VERRI

FEDERICO TOMASI

STEFANO ROVETTA

SAMUELE FIORINI

FRANCESCO MASULLI

LEZIONI

Modalità didattiche

Lezioni in aula (44 ore), in laboratorio (12 ore), progetto (50 ore) e studio a casa.
Gli studenti dovranno frequentare le lezioni ed i laboratori per un totale di 6 ore a settimana.

ESAMI

Modalità d'esame

Esame orale e discussione progetto